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上海东寰与您分享斑点交联术

一、实验材料

1RNA待测样本(注:本人用的是直接提取的RNA,为了实验更严谨,应当先进行mRNA纯化)

2,无酶水

3TBST1×TBS0.1%Tween-20

4,封闭液

5,一抗

6,二抗

7ECL显影液

8,亚甲蓝染色缓冲液(0.4M醋酸钠、0.4M醋酸中的0.2%亚甲蓝)

二,实验设备

无酶EP

加热设备

NC膜 或 带正电荷的尼龙膜(建议使用尼龙膜,专门用来做核酸交联,效果比NC膜好)

干净的塑料盒或者培养皿

烘箱或者带有254nm灯泡的交联设备(可用紫外线消毒灯代替,1m范围内有效)

显影设备

三,流程

1,取出待测RNA样本,解冻后测量RNA浓度,全程冰上操作。

2,将样品浓度统一,并在新的无酶管连续稀释样品并混匀,稀释梯度不固定,可自己试试最好效果。我选择的终浓度为400/200/100 ng/μL

3,离心后,将RNA样品95℃加热3分钟以破坏二级结构,结束后立即冰上冷却,防止重新形成二级结构。

4,用1ml枪头粗端在NC膜上留下圆形印记,以引导加样,随后将NC膜裁剪成合适的尺寸,转移至干净的塑料盒中。

5,将2μl RNA样品按顺序滴在NC膜上,注意枪头不要碰膜,样品应在膜上自然扩散,每次加样都需要更换枪头。

6,室温下NC膜上稍干燥后可进行RNA与膜的交联。方法一:37℃烘箱 30min。方法二:254nm波长的紫外线灯下照射30min-1h

710ml TBST清洗膜5min,洗去未结合的RNA

8,弃去TBST,加入10ml封闭液,室温摇动孵育1小时。

9,弃去封闭液,加入含有一抗的封闭液4℃孵育过夜。

10,10ml TBST清洗膜3次,每次10min

11,二抗室温孵育1小时。

12,同第10步。

13ECL底物孵育5min

14,显影仪下拍照

15,拍完照后,将膜放置于10ml亚甲蓝染色缓冲液中,室温摇动孵育30min

16,用ddH2O清洗至背景大致干净即可,约30-60s

17,白光成像采集亚甲蓝染色后的图像作为负载对照。

 

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